Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASGRF1Q13972 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms