Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCINQ13939 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms