Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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