Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms