Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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