Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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