Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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