Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2BQ13224 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
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