Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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