Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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