Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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TRIM32Q13049 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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TRIM32Q13049 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRIM32Q13049 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRIM32Q13049 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRIM32Q13049 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRIM32Q13049 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM32Q13049 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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