Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNH2Q12809 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms