Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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