Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms