Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms