Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms