Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA3Q08378 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms