Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms