Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TYRO3Q06418 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYRO3Q06418 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms