Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms