Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms