Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OC90Q02509 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OC90Q02509 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OC90Q02509 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OC90Q02509 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms