Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P63121 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms