Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1AP62820 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms