Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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