Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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