Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms