Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC01547P58512 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms