Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP107P57740 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms