Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms