Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms