Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms