Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms