Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms