Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX2P50458 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms