Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms