Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA4P43694 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA4P43694 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA4P43694 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms