Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK1P39086 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms