Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms