Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGER4P35408 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms