Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC1P33527 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms