Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms