Protein–RNA interactions for Protein: P25942

CD40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40P25942 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40P25942 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40P25942 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40P25942 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40P25942 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40P25942 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40P25942 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms