Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms