Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms