Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms