Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RASA1P20936 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RASA1P20936 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASA1P20936 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RASA1P20936 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASA1P20936 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASA1P20936 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms