Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms