Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NME1P15531 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME1P15531 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME1P15531 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms