Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRF1P14222 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms